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在陈凯丽的点拨下，李宇轩的代码重构生物世界大业取得一系列的进展，首先他定一个一个类，叫做生物类，给这个类定义了基本的一个属性：生存目标，默认值为两个，繁殖与存活，以及能量值属性。定义了几个方法：繁殖，死亡，遗传，演化，获取能量，设置了几个事件：当能量低于阈值时，当能量满足时，当环境适合繁殖时，当繁殖时，当繁殖成功时，当空闲时，当忙碌时。
从生物类六界系统分类下，向下定义和派生子类，定义出病毒界类、原核生物界类、真菌界类、原生生物界类、植物界类和动物界类，这些类继承了生物类的属性、方法和事件，并逐个进行重写和丰富各子类的内容。
病毒是颗粒很小、以纳米为测量单位、结构简单、寄生性严格、以复制进行繁殖的一类非细胞型微生物。 病毒是比细菌还小、没有细胞结构、只能在活细胞中增殖的微生物。病毒由蛋白质和核酸组成。病毒界类的属性在继承生物父类的属性，具有繁殖和存活的目标属性，病毒本身没有细胞构造，其主要成分仅为核酸和蛋白质两种，故又称“分子生物”：每一种病毒只含一种核酸，不是dNA就是RNA，病毒只能利用宿主的存活细胞内现成代谢系统合成自身的核酸和蛋白质成分，以核酸和蛋白质等“元件”的装配实现其大量繁殖；在离开宿主活细胞的条件下，有些病毒能以无生命的生物大分子状态存在，并长期保持其侵染活力。
dNA和RNA是核酸的两种类型，dNA是脱氧核糖核酸，RNA是核糖核酸。dNA(脱氧核糖核酸)的基本组成部分是脱氧核苷酸。脱氧核苷酸是一类由嘌呤或嘧啶碱基 、脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的小分子化合物 ，是构成生物体遗传物质dNA的物质基础 。脱氧核苷酸中四种碱基腺嘌呤 （adenine，缩写为A）、胸腺嘧啶（thymine，缩写为t）、胞嘧啶（cytosine，缩写为c）和鸟嘌呤（guanine，缩写为G）排列顺序的不同，决定了生物的多样性。RNA是核糖核酸的基本组成部分是核苷酸，核苷酸是一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种，即A（腺嘌呤）、G（鸟嘌呤）、c（胞嘧啶）、U（尿嘧啶），其中，U（尿嘧啶）取代了dNA中的t（胸腺嘧啶）。
李宇轩严格按照陈凯丽提供的生物知识的结构，又单独定义了dNA类、RNA类、以及碱基类和碱基类的子类，AGcUt。生物的遗传物质，正是通过这些碱基的不同排列组合传递的，如何组合传递如何的信息，已经不在李宇轩的研究范畴，他严谨的只是建立好了类的结构。李宇轩问过张凯丽，这些碱基是否都有明确的化学结构和分子式，张凯丽只要是存在的，一定有明确的化学结构和分子式，而其自身的组合，就无穷无尽了，无论组合，都只是碳、氢、氧、氮四个元素的组合。
李宇轩惊讶的感叹道：\"那岂不是可以人造这些dNA、RNA，在通过他们的组合存放下我这个类定义的代码。代码重构生物，生物记录代码。\"
张凯丽打趣道：\"理论上是可以的，弄好了，你就是造世主了，到时候把我造的更漂亮点，我就不来辛苦读这个博士了，靠扭扭腰吃饭，活的俗不可耐一点。\"
定义原核生物界类的时候，李宇轩同时定义了细胞类。原核生物 是一种单细胞生物，缺乏细胞核和其他膜结合细胞器。在生物分类的三域系统中，基于分子分析，原核生物分为两个域：细菌（原真细菌）和古细菌（原古细菌）。 具有细胞核的生物体位于第三个领域，即真核生物。
在生命起源的研究中，原核生物被
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