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张军带着应急小组入户调查，发现赵来福家里养着观赏性水生植物——滴水观音，水瓶中漂浮着许多蚊蚴，院子里也种着许多绿植，隔着半人多高围墙的隔壁赵大树家的院子里还堆着许多制鞋废料，有苍蝇和蚊子在院子内飞舞。详细询问了赵来福在马来西亚的工作生活经历，发现他在马来西亚居住地是登革热疫区。采集了赵来福的血清标本，经疾控实验室检测，登革热IgG抗体阳性、核酸阳性。
赵来福因此被确定为本次疫情的首发病例。
病例吴大力是赵来福的工友，同时从东南亚回国，回到云溪镇吴家村，发病时间比赵来福晚7天，并在发病的5天后，同住的其他家人出现发热症状。
应急小组推测，赵来福和吴大力在东南亚时感染登革热病毒，回国后先后发病，并通过伊蚊叮咬将登革热病毒传播至周围环境伊蚊中，周围人群被携带登革热病毒的传播媒介——伊蚊叮咬感染，造成登革热疫情扩散。赵来福和吴大力是本次输入性登革热疫情的传染源。
经过现场流行病学调查，除了首发病例赵来福的资料，还得到了云溪镇其他登革热病例的时间、地理、人群分布情况。
拿到这些信息后，流调组开始划定疫点和疫区，划定以每个病例居住家庭或工作场所为中心周围半径100米的范围内，作为疫点。划定云溪镇为疫区。
应急小组开始规范发热患者管理。对来自云溪镇及周围乡镇的发热患者进行登记即日报告制度，对疑似病例，采集血清标本，进行实验室检测。对现症患者实行住院隔离，隔离期限以发病之日起不少于7天，对登革热疑似病例做好流行病学调查，对接触者进行15天医学观察。
确定本次疫情为登革热疫情的同时，市应急小组指导县疾控对云溪镇进行病媒监测。
初期，流调小组在云溪镇共捕获成蚊128只，其中白纹伊蚊26只，占20.31%。捕获蚊蚴400余条，检查19户家庭，共有积水容器96只，其中18户家庭的62只积水容器中白纹伊蚊幼虫阳性。经计算，布雷图指数326，容器指数64.58%，房屋指数94.74%。
布雷图指数（breteau Inde x）是评价一个地区伊蚊密度的指标，也就是平均每百户内有伊蚊幼虫孳生的容器数。“布雷图指数”在5以下，属于安全范围；如果该指数高于20，意味着一旦有外部病例输入，就可能在该地区造成蚊媒传染病的流行。
通过对云溪镇和周围几个乡村（吴家村作为重点调查村）的蚊虫密度调查，布雷图指数竟高达100以上，已经远远高于安全范围，蚊子密度过高是外部病例输入引起本地疫情暴发的关键原因。
之后，消杀组开始协助疫点疫区进行室内外紧急灭蚊，迅速降低成蚊密度，用药物灭蚊的同时，采取各种措施消除蚊子孳生地地，全面进行翻盘倒罐，填塞竹洞树洞，铲除杂草，疏通下水道、河道，处理室内各种小积水、花瓶、盆景，同时加强疫区内蚊虫密度监测，很快疫区的布雷图指数降低至5以内。
应急小组对早期病例和特殊病例的传播链进行调查，首发病例赵来福居住地周围半径30米范围内，共发生14例实验室确诊登革热病例，其中赵大树、赵小花和赵小果一家三口就住在首发病例赵来福隔壁，物理距离10米范围内。
现住院的女护士是曾经护理过首发病例赵来福的护士。
在对病例扩大搜索时，还发现了5例不在云溪镇居住的患者，经过流行病学调查，发现这5例患者在发病前15天内均有去疫区云溪镇短暂居住或逗留史及蚊虫叮咬史。根据暴露时间推算，该5例患者的潜伏期在4~10天之间。
几天后，疾控实验室从患者标本中分离出本次疫情登革热病毒，并
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