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在第一次清洗过大地之后，将自己吞噬掉的人类负面情绪剥离出来，与之相伴的还有权贵们的基因修改器和营养补剂器。
在剥离情绪的时候，不可避免地也会沾染到基因与记忆，或者说情绪来源于记忆，记忆来源于基因，以至于情绪变成了基因和记忆承载物，化作了一团蕴含有特殊记忆传承的东西。
当然它们还有另外两个名字——动物灵光和生命原汤。
清洗掉自己身上不好的存在后，祂开始从自己的躯体里找到了纯洁五污染的人类基因，重新塑造了人类始祖，随后又塑造了其他基因纯洁的动物。
当然，此时的上帝只是一团橙色的海水，所以祂没法完成太多的细致操作，所以他又塑造了拥有特殊能力的天使操作自己没法细致操作的事物，帮助自己重现没有基因修改技术的世界。
这也是为什么天使是上帝的造物，上帝却更爱人类的原因，尽管它们拥有强大的能力，但是到底是被基因修改技术污染过的存在。
神话中，亚当和夏娃吃掉的智慧禁果，其实就是带有大清洗前人类记忆的动物灵光，也正是因为拥有了人类中其他科学家的记忆，所以亚当和夏娃也学会了制造基因修改器和营养补剂器。
于是被盛怒的上帝赶出了伊甸园，尽管没有另一种禁果，但是有着完整知识的亚当和夏娃，很快就利用姆大陆上残存的人类遗迹，在落后的条件下制造出了猴版的生命原汤，在动物灵光中的负面情绪引诱下，追求力量和长生。
在漫长的时光中，亚当和夏娃的后裔再次繁衍占据了星球，并且越来越堕落，甚至开始追求记忆中的巴别塔堆砌力量，企图通过更高的巴别塔吸纳更多的基因，筛选出一个属于人类的神，对抗上帝，然后建立一个新亚特兰蒂斯。
巴别塔的重新诞生终于触怒了在赶走亚当和夏娃后，就离开亚特兰蒂斯所在的姆大陆，盘踞在深海的上帝。
这一次祂决定彻底清洗整个世界，只吞噬掉被基因修改技术和动物灵光污染人类还不够，还要将存在亚特兰蒂斯遗迹的整片大陆击碎，让后面的新人类哪怕拥有基因修改技术和营养补剂技术也没法轻易做到扭曲人与人位格。
这一次的灭世，上帝彻底摧毁了亚特兰蒂斯，并且完全吞噬了所有的生命原汤和动物灵光，将其束缚在自己身体里的一小块区域——那里是后世宗教意义上的地狱。
当然，因为阶级的存在，所以不是所有的人类都接受过基因修改，只要基数足够大，就会诞生知道基因修改技术和营养补剂技术，却没有实践的纯洁人类。
诺亚就是这样一个精通各种亚特兰蒂斯知识，却因为没有使用基因修改技术，所以逃过了清洗的幸运儿。
完成了第二次灭世之后，上帝选择重归深海，盘踞在亚特兰蒂斯废墟上，保证没有任何生物能够利用亚特兰蒂斯遗迹，因为任何活物只要一接触他的身体就会被橙色海洋分解吸收。
而雨过天晴后的诺亚，来到了亚拉腊山上重新开启了西亚的人类文明，同时在又一次被削弱的情况下复现出了青春猴版基因修改技术。
由于幸存下来的亚特兰蒂斯遗民都知道是巴别塔惹怒了上帝，所以大家都很默契地不再染指大规模的基因修改，只将技术用作个人的进化和享乐。
同样因为灭世而重新恢复活动的上帝也开始频繁派遣天使干涉人间，保证人间不再能够传承完整的基因修改技术。
当确定最完整的基因修改技术都被肃清以后，上帝重归平静。
而因为新技术是原版的二次劣化，以至于连强化和延寿方面都大打折扣，诺亚终究是在自己一千岁的时候预感到了自己的死期。
于是他将带着自己躲避了灭世洪水，用基因修改技术制造的诺亚方舟改造成了一
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